病案去标识工具
Introduction
面向病案科、质控科与临床科研人员的病案首页去标识化工具。把数据里的病案号 替换为不可逆的研究ID(形如 PID074f…),同一患者多次住院得到同一ID, 可直接做再入院、重复住院等纵向研究;研究ID 无法反推病案号,伦理合规。 核心能力 1. 确定性哈希:研究ID = HMAC-SHA256(密钥, 病案号)。同一密钥 + 同一病案号 永远得到同一研究ID;不同密钥之间互不相通。 2. 病案号归一化(解决跨期对不上的致命问题): ="0841651"(Excel 公式包装)、841651.0(数字尾巴)、0841651(前导零)、 全角空格——全部归一为同一个ID。老 CSV 与新 xlsx 混批,同一患者不会变两个ID。 3. 批量转换:多文件共用同一密钥,各文件列顺序不同也能按列名自动匹配。 4. 增量转换:新增年份的数据在同一导出目录再跑一次即可(默认沿用 key.bin), 老患者ID不变、新患者自动分配新ID,无需重跑旧文件。 5. 干跑统计:先看唯一患者数、住院≥2次分布(占比<5%提示病案号可能是住院号), 不产生任何文件。 6. 研究者版自动删除姓名列;对照表、总对照表、key.bin 由病案科留存的输出规则。 隐私与合规(重点) - 全程本机离线,无网络请求,数据与密钥不出机。 - 强制 HMAC 密钥模式:无密钥的公开盐值哈希在病案号可枚举的场景下可被 字典攻击还原,本工具已移除该回退——假名化不等于去标识化。 - 密钥(key.bin)与对照表是唯一可还原映射的凭据,必须由病案科单独保管。 - 研究ID 不可逆 ≠ 数据集整体合规:是否含罕见特征组合等准标识符, 仍需使用者完成伦理审查与院内审批。 快速开始 scan 干跑统计 python scripts/deid_cli.py scan "数据目录" convert 批量转换 python scripts/deid_cli.py convert "数据目录" --out-dir "导出目录" 增量转换 同上(同一 --out-dir 默认沿用密钥) selftest 核心逻辑自检 python scripts/deid_cli.py selftest(28 项,exit 0 = 全过) 依赖:Python 3.10+,openpyxl(处理 xlsx 需要)。 搭配使用 与「病案首页数据处理器」是标准搭档:先用本工具把病案号换成研究ID, 再做质控与指标统计——后者已兼容 研究ID 作为替代主键。
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